Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CUL4AQ13619 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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