Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC63Q05C16 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC63Q05C16 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms