Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A2Q05940 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A2Q05940 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms