Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1BQ01064 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms