Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A1P54219 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A1P54219 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A1P54219 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms