Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGGT1BP53609 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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