Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN1CP49918 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms