Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC2P49815 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC2P49815 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC2P49815 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC2P49815 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSC2P49815 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC2P49815 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC2P49815 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC2P49815 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC2P49815 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC2P49815 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSC2P49815 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSC2P49815 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC2P49815 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC2P49815 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC2P49815 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC2P49815 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC2P49815 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC2P49815 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC2P49815 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC2P49815 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC2P49815 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC2P49815 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC2P49815 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC2P49815 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC2P49815 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC2P49815 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC2P49815 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC2P49815 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC2P49815 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC2P49815 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC2P49815 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC2P49815 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC2P49815 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC2P49815 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC2P49815 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC2P49815 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC2P49815 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC2P49815 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC2P49815 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC2P49815 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms