Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UTRNP46939 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UTRNP46939 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UTRNP46939 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UTRNP46939 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UTRNP46939 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UTRNP46939 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UTRNP46939 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UTRNP46939 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UTRNP46939 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UTRNP46939 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UTRNP46939 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UTRNP46939 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UTRNP46939 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UTRNP46939 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UTRNP46939 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UTRNP46939 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UTRNP46939 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UTRNP46939 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UTRNP46939 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UTRNP46939 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UTRNP46939 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UTRNP46939 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UTRNP46939 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UTRNP46939 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UTRNP46939 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UTRNP46939 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UTRNP46939 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UTRNP46939 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UTRNP46939 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UTRNP46939 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UTRNP46939 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UTRNP46939 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UTRNP46939 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UTRNP46939 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UTRNP46939 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UTRNP46939 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UTRNP46939 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UTRNP46939 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UTRNP46939 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UTRNP46939 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UTRNP46939 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UTRNP46939 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UTRNP46939 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
UTRNP46939 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UTRNP46939 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UTRNP46939 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UTRNP46939 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UTRNP46939 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UTRNP46939 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UTRNP46939 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UTRNP46939 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UTRNP46939 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UTRNP46939 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UTRNP46939 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UTRNP46939 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UTRNP46939 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UTRNP46939 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UTRNP46939 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UTRNP46939 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UTRNP46939 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UTRNP46939 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UTRNP46939 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UTRNP46939 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UTRNP46939 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UTRNP46939 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms