Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCAP28676 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCAP28676 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCAP28676 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCAP28676 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCAP28676 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCAP28676 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCAP28676 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCAP28676 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCAP28676 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCAP28676 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCAP28676 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCAP28676 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCAP28676 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCAP28676 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCAP28676 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCAP28676 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCAP28676 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GCAP28676 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCAP28676 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCAP28676 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCAP28676 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCAP28676 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCAP28676 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCAP28676 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCAP28676 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCAP28676 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCAP28676 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCAP28676 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCAP28676 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCAP28676 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCAP28676 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms