Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO2P25791 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO2P25791 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO2P25791 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO2P25791 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO2P25791 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO2P25791 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO2P25791 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO2P25791 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO2P25791 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO2P25791 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO2P25791 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO2P25791 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO2P25791 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO2P25791 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO2P25791 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO2P25791 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO2P25791 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO2P25791 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO2P25791 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO2P25791 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO2P25791 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO2P25791 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO2P25791 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO2P25791 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO2P25791 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO2P25791 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO2P25791 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO2P25791 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO2P25791 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMO2P25791 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMO2P25791 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO2P25791 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO2P25791 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO2P25791 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO2P25791 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms