Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RXRAP19793 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RXRAP19793 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RXRAP19793 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RXRAP19793 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RXRAP19793 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RXRAP19793 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RXRAP19793 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RXRAP19793 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RXRAP19793 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RXRAP19793 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RXRAP19793 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RXRAP19793 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RXRAP19793 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RXRAP19793 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RXRAP19793 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RXRAP19793 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RXRAP19793 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms