Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF44P15621 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF44P15621 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms