Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTHFD1P11586 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFD1P11586 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms