Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APODP05090 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APODP05090 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APODP05090 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APODP05090 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APODP05090 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APODP05090 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APODP05090 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APODP05090 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APODP05090 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APODP05090 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APODP05090 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APODP05090 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APODP05090 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APODP05090 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APODP05090 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APODP05090 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APODP05090 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APODP05090 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APODP05090 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APODP05090 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APODP05090 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APODP05090 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APODP05090 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APODP05090 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms