Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPN1P04843 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPN1P04843 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPN1P04843 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN1P04843 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN1P04843 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN1P04843 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN1P04843 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN1P04843 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN1P04843 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN1P04843 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN1P04843 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPN1P04843 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN1P04843 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN1P04843 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN1P04843 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN1P04843 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN1P04843 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN1P04843 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN1P04843 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN1P04843 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN1P04843 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN1P04843 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPN1P04843 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPN1P04843 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPN1P04843 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPN1P04843 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPN1P04843 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN1P04843 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN1P04843 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN1P04843 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN1P04843 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN1P04843 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN1P04843 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN1P04843 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN1P04843 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN1P04843 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN1P04843 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN1P04843 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN1P04843 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN1P04843 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN1P04843 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN1P04843 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN1P04843 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN1P04843 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN1P04843 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN1P04843 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN1P04843 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms