Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2P04141 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2P04141 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2P04141 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2P04141 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2P04141 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2P04141 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2P04141 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2P04141 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2P04141 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2P04141 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2P04141 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2P04141 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2P04141 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2P04141 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2P04141 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2P04141 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2P04141 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2P04141 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2P04141 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2P04141 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2P04141 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2P04141 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2P04141 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2P04141 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2P04141 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2P04141 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2P04141 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF2P04141 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF2P04141 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF2P04141 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms