Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms