Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN1O60635 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN1O60635 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN1O60635 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms