Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAD1O00515 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAD1O00515 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LAD1O00515 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAD1O00515 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAD1O00515 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LAD1O00515 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAD1O00515 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAD1O00515 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAD1O00515 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAD1O00515 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAD1O00515 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAD1O00515 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAD1O00515 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAD1O00515 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAD1O00515 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAD1O00515 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAD1O00515 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAD1O00515 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAD1O00515 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAD1O00515 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAD1O00515 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAD1O00515 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAD1O00515 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAD1O00515 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAD1O00515 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAD1O00515 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAD1O00515 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAD1O00515 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAD1O00515 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAD1O00515 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAD1O00515 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAD1O00515 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAD1O00515 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAD1O00515 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAD1O00515 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAD1O00515 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAD1O00515 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAD1O00515 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAD1O00515 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAD1O00515 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAD1O00515 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAD1O00515 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAD1O00515 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAD1O00515 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAD1O00515 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAD1O00515 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAD1O00515 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms