Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHMG1C9JSJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMG1C9JSJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms