Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L9A6NEM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L9A6NEM1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms