Protein–RNA interactions for Protein: A1L188

NDUFAF8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF8A1L188 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NDUFAF8A1L188 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NDUFAF8A1L188 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms