Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQA8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQA8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQA8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQA8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQA8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQA8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQA8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQA8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQA8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U3KQA8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U3KQA8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U3KQA8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQA8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQA8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQA8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQA8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQA8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQA8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQA8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQA8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQA8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQA8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQA8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQA8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms