Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF12Q9Y4X4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms