Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COG6Q9Y2V7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG6Q9Y2V7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms