Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
USP35Q9P2H5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
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