Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1B3Q9NPD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms