Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC40A1Q9NP59 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC40A1Q9NP59 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms