Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DENND2DQ9H6A0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND2DQ9H6A0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms