Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB1Q9H4B7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB1Q9H4B7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms