Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA4Q9GZZ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GFRA4Q9GZZ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms