Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD60Q9BZ19 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD60Q9BZ19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD60Q9BZ19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms