Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3CQ99613 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3CQ99613 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3CQ99613 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms