Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC136Q96JN2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC136Q96JN2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC136Q96JN2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms