Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC34Q96HJ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC34Q96HJ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms