Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RCN3Q96D15 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms