Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX1Q92499 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms