Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A1Q8WWI5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A1Q8WWI5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms