Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRYD3Q8NCJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRYD3Q8NCJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRYD3Q8NCJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms