Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF165Q6ZSG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF165Q6ZSG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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