Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC62Q6P9F0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC62Q6P9F0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms