Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNCKQ6P2M8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms