Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSBN1Q5VWQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms