Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPO2Q5TGU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms