Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TIMM23BQ5SRD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 378.8 ms