Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIK1Q3SY52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIK1Q3SY52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms