Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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