Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPEL1Q2QD12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPEL1Q2QD12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms