Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A9Q2M3M2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A9Q2M3M2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A9Q2M3M2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms